Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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