Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MDC1Q14676 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDC1Q14676 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms