Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBR1Q14596 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms