Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms