Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CKAP5Q14008 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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