Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H3Q13889 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H3Q13889 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H3Q13889 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H3Q13889 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H3Q13889 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H3Q13889 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H3Q13889 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H3Q13889 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H3Q13889 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H3Q13889 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H3Q13889 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H3Q13889 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms