Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms