Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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