Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTCH1Q13635 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTCH1Q13635 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
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