Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC1Q13547 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
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