Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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