Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIGQ13278 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms