Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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PTGDRQ13258 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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PTGDRQ13258 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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PTGDRQ13258 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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PTGDRQ13258 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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PTGDRQ13258 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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PTGDRQ13258 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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PTGDRQ13258 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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PTGDRQ13258 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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PTGDRQ13258 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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PTGDRQ13258 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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PTGDRQ13258 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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PTGDRQ13258 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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PTGDRQ13258 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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PTGDRQ13258 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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