Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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