Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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TRAF1Q13077 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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TRAF1Q13077 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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TRAF1Q13077 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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TRAF1Q13077 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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TRAF1Q13077 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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TRAF1Q13077 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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TRAF1Q13077 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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TRAF1Q13077 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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