Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC16Q13042 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms