Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.59e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 ARIH2-207ENST00000452385 2778 ntTSL 28.64□□□□□ -1.033e-6■■■□□ 16
ILF3Q12906 HP1BP3-210ENST00000438032 1159 ntTSL 520.39■□□□□ 0.854e-12■■■□□ 16
ILF3Q12906 HP1BP3-208ENST00000424732 970 ntTSL 318.09■□□□□ 0.494e-12■■■□□ 16
ILF3Q12906 ABCC1-207ENST00000575422 1198 ntTSL 515.89■□□□□ 0.132e-6■■■□□ 16
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ILF3Q12906 POLG2-208ENST00000582501 925 ntTSL 59.38□□□□□ -0.914e-12■■■□□ 16
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ILF3Q12906 POLG2-205ENST00000580490 510 ntTSL 36.83□□□□□ -1.324e-12■■■□□ 16
ILF3Q12906 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.362e-6■■■□□ 16
ILF3Q12906 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.722e-6■■■□□ 16
ILF3Q12906 POLG2-209ENST00000585104 271 ntTSL 34.14□□□□□ -1.754e-12■■■□□ 16
ILF3Q12906 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.012e-6■■■□□ 16
ILF3Q12906 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.218e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 PTH2R-202ENST00000419079 811 ntTSL 26.07□□□□□ -1.441e-6■■■□□ 16
ILF3Q12906 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.253e-9■■■□□ 16
ILF3Q12906 CHEK1-203ENST00000428830 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.43e-9■■■□□ 16
ILF3Q12906 CHEK1-201ENST00000278916 1712 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.553e-9■■■□□ 16
ILF3Q12906 CHEK1-218ENST00000544373 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.713e-9■■■□□ 16
ILF3Q12906 CHEK1-204ENST00000438015 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.83e-9■■■□□ 16
ILF3Q12906 CHEK1-206ENST00000524737 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.813e-9■■■□□ 16
ILF3Q12906 CHEK1-213ENST00000532449 4051 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.813e-9■■■□□ 16
ILF3Q12906 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.543e-9■■■□□ 16
ILF3Q12906 USP22-209ENST00000579645 1906 ntTSL 518.8■□□□□ 0.63e-9■■■□□ 16
ILF3Q12906 USP22-204ENST00000476111 573 ntTSL 318.35■□□□□ 0.533e-9■■■□□ 16
ILF3Q12906 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.193e-9■■■□□ 16
ILF3Q12906 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.363e-9■■■□□ 16
ILF3Q12906 USP22-211ENST00000584538 554 ntTSL 411.7□□□□□ -0.543e-9■■■□□ 16
ILF3Q12906 USP22-202ENST00000455117 677 ntTSL 510.22□□□□□ -0.773e-9■■■□□ 16
ILF3Q12906 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.947e-6■■■□□ 16
ILF3Q12906 PRKCZ-208ENST00000468310 690 ntTSL 521.48■■□□□ 1.033e-6■■■□□ 16
ILF3Q12906 PRKCZ-201ENST00000378567 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)21.17■□□□□ 0.983e-6■■■□□ 16
ILF3Q12906 PRKCZ-210ENST00000470596 788 ntTSL 220.97■□□□□ 0.953e-6■■■□□ 16
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ILF3Q12906 PRKCZ-222ENST00000496325 563 ntTSL 415.66■□□□□ 0.13e-6■■■□□ 16
ILF3Q12906 PRKCZ-221ENST00000495347 698 ntTSL 415.41■□□□□ 0.063e-6■■■□□ 16
ILF3Q12906 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.063e-6■■■□□ 16
ILF3Q12906 PRKCZ-207ENST00000466651 425 ntTSL 511.7□□□□□ -0.543e-6■■■□□ 16
ILF3Q12906 PRKCZ-217ENST00000481140 713 ntTSL 47.31□□□□□ -1.243e-6■■■□□ 16
ILF3Q12906 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.797e-7■■■□□ 16
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ILF3Q12906 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.37e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 DIP2B-204ENST00000549620 2676 ntTSL 1 (best)17.44■□□□□ 0.386e-7■■■□□ 16
ILF3Q12906 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.226e-7■■■□□ 16
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ILF3Q12906 AMFR-209ENST00000567738 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.81□□□□□ -0.844e-9■■■□□ 16
ILF3Q12906 AMFR-207ENST00000566334 426 ntTSL 29.36□□□□□ -0.914e-9■■■□□ 16
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ILF3Q12906 TYK2-216ENST00000530829 720 ntTSL 518.92■□□□□ 0.626e-7■■■□□ 15.9
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ILF3Q12906 TYK2-201ENST00000264818 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.676e-7■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 TYK2-202ENST00000524462 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.696e-7■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.166e-6■■■□□ 15.9
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ILF3Q12906 PTK7-201ENST00000230418 3958 ntTSL 1 (best)13.89□□□□□ -0.196e-6■■■□□ 15.9
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ILF3Q12906 NDUFS1-202ENST00000423725 2631 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -11e-8■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.271e-8■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.291e-8■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 NDUFS1-208ENST00000456284 563 ntTSL 46.54□□□□□ -1.361e-8■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.421e-8■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.531e-8■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 SYCP2L-205ENST00000487561 644 ntTSL 35.19□□□□□ -1.583e-7■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-47■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.668e-7■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 GIPR-203ENST00000585889 1414 ntTSL 1 (best)18.72■□□□□ 0.598e-7■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.388e-7■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.428e-7■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.21e-6■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.867e-7■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.067e-7■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 CDC14A-201ENST00000336454 4137 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.487e-7■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 ADGRV1-208ENST00000509621 5211 ntTSL 1 (best)9.31□□□□□ -0.928e-9■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 ADGRV1-231ENST00000640374 5401 ntTSL 57.71□□□□□ -1.188e-9■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 ADGRV1-236ENST00000640779 4680 ntTSL 57.07□□□□□ -1.288e-9■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 ADGRV1-224ENST00000640012 3241 ntTSL 56.3□□□□□ -1.48e-9■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 ADGRV1-218ENST00000639473 6608 ntTSL 56.27□□□□□ -1.418e-9■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 CDC14A-204ENST00000455467 841 ntTSL 34.97□□□□□ -1.617e-7■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.647e-7■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 ADGRV1-217ENST00000639431 611 ntTSL 54.81□□□□□ -1.648e-9■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 ADGRV1-232ENST00000640403 6723 ntTSL 53.74□□□□□ -1.818e-9■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.858e-9■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 SPG7-213ENST00000566221 734 ntTSL 314.54□□□□□ -0.084e-6■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 SPG7-222ENST00000569820 2305 ntTSL 511.08□□□□□ -0.644e-6■■■□□ 15.9
ILF3Q12906 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.079e-7■■■□□ 15.8
ILF3Q12906 MDM2-212ENST00000393416 754 ntTSL 57.22□□□□□ -1.255e-7■■■□□ 15.8
ILF3Q12906 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.314e-11■■■□□ 15.8
ILF3Q12906 NFAT5-210ENST00000567990 2855 ntTSL 513.81□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 15.8
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