Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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KCNMA1Q12791 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMA1Q12791 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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