Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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FOXO1Q12778 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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FOXO1Q12778 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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FOXO1Q12778 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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FOXO1Q12778 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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FOXO1Q12778 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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FOXO1Q12778 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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FOXO1Q12778 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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