Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms