Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD3Q0VAK6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms