Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSRP1Q08945 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSRP1Q08945 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms