Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GOLGA3Q08378 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms