Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms