Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
FMODQ06828 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms