Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNEQ04844 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms