Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms