Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP27A1Q02318 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms