Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms