Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTBN1Q01082 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms