Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITPNAQ00169 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms