Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERV-K104P61576 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms