Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms