Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA3P59666 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms