Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFDNP55196 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AFDNP55196 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFDNP55196 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFDNP55196 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFDNP55196 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFDNP55196 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFDNP55196 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFDNP55196 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFDNP55196 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFDNP55196 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFDNP55196 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFDNP55196 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFDNP55196 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFDNP55196 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFDNP55196 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFDNP55196 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AFDNP55196 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AFDNP55196 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AFDNP55196 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AFDNP55196 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AFDNP55196 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AFDNP55196 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AFDNP55196 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AFDNP55196 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AFDNP55196 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFDNP55196 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFDNP55196 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFDNP55196 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFDNP55196 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFDNP55196 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFDNP55196 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFDNP55196 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFDNP55196 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AFDNP55196 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AFDNP55196 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms