Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms