Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms