Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DAP3P51398 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms