Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDO2P48775 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDO2P48775 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDO2P48775 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDO2P48775 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDO2P48775 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDO2P48775 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDO2P48775 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDO2P48775 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDO2P48775 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TDO2P48775 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDO2P48775 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDO2P48775 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDO2P48775 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDO2P48775 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDO2P48775 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDO2P48775 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDO2P48775 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDO2P48775 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms