Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTRNP46939 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTRNP46939 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTRNP46939 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UTRNP46939 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms