Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL3P36405 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL3P36405 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL3P36405 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL3P36405 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL3P36405 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL3P36405 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL3P36405 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL3P36405 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL3P36405 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL3P36405 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL3P36405 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL3P36405 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL3P36405 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL3P36405 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL3P36405 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL3P36405 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL3P36405 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms