Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
THBS4P35443 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
THBS4P35443 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
THBS4P35443 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
THBS4P35443 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
THBS4P35443 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
THBS4P35443 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
THBS4P35443 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
THBS4P35443 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
THBS4P35443 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
THBS4P35443 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
THBS4P35443 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
THBS4P35443 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
THBS4P35443 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
THBS4P35443 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
THBS4P35443 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
THBS4P35443 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
THBS4P35443 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
THBS4P35443 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
THBS4P35443 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
THBS4P35443 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
THBS4P35443 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
THBS4P35443 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
THBS4P35443 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
THBS4P35443 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
THBS4P35443 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
THBS4P35443 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
THBS4P35443 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
THBS4P35443 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
THBS4P35443 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
THBS4P35443 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms