Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFC1P35251 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFC1P35251 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFC1P35251 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFC1P35251 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFC1P35251 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFC1P35251 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFC1P35251 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFC1P35251 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFC1P35251 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFC1P35251 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RFC1P35251 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFC1P35251 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RFC1P35251 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFC1P35251 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFC1P35251 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFC1P35251 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFC1P35251 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFC1P35251 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFC1P35251 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFC1P35251 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFC1P35251 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFC1P35251 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFC1P35251 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RFC1P35251 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFC1P35251 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFC1P35251 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFC1P35251 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFC1P35251 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFC1P35251 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFC1P35251 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RFC1P35251 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms