Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms