Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPC1P35052 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms