Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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