Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB2P29033 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB2P29033 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GJB2P29033 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB2P29033 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB2P29033 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms