Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT1P21579 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT1P21579 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT1P21579 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT1P21579 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT1P21579 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT1P21579 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT1P21579 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms