Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PVALBP20472 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PVALBP20472 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PVALBP20472 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PVALBP20472 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PVALBP20472 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PVALBP20472 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PVALBP20472 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PVALBP20472 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PVALBP20472 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PVALBP20472 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PVALBP20472 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PVALBP20472 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms