Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms